Dr Fuji , die wil om een manier om het leven te herstellen door klonen te vinden, gaat naar Guyana na het vinden van het bewijs van een heiligdom gewijd aan Mew , 's werelds meest krachtige - maar nu gezegd dat ze uitgestorven -. Pokemon Giovanni , de leider van Team Rocket , fondsen Fuji Het onderzoek in ruil voor een verbeterde woon replica van Mew. Het vinden van een fossiel van Mew, Fuji en zijn team creëren Mewtwo . Een verwarde Mewtwo vraagt ​​zich af wie hij is, wat hij is, en waar hij vandaan kwam. Op dat moment Mewtwo wordt wakker in een stasis buis in een van de Fuji's laboratoria, waar de wetenschappers bestuderen hem. Mewtwo breekt uit zijn reageerbuis; Dr Fuji vertelt Mewtwo dat hij is gemaakt door mensen en is een kloon, veel krachtiger dan Mew. Mewtwo is boos dat de wetenschappers hem meer zien als een eindresultaat om hun project en minder van een bewust wezen, zodat hij vernietigt het laboratorium en doodt alle wetenschappers. Dr Fuji zegt tegen zichzelf dat hij er in geslaagd 's werelds meest krachtige Pokemon alvorens te sterven in de handen van Mewtwo. Dan, Giovanni komt in zijn prive-helikopter en biedt aan te helpen Mewtwo focussen zijn bevoegdheden. Mewtwo neemt het aanbod, en wordt in een harnas.

In de komende weken, Mewtwo doet het meeste vuil Team Rocket het werk, het vastleggen van wilde Pokemon en het verslaan van alle trainers die in de Gym komen in Viridian City , met inbegrip van Gary Oak . Toen Giovanni vertelt Mewtwo zijn eigen verdraaide manier van het regelen van Pokemon, Mewtwo boos ontploffing weg, het vernietigen van zijn harnas, en - boven op het eiland dat hij is gemaakt op - geloften om te beginnen met zijn regering op aarde.

Ondertussen, Ash , Misty en Brock zijn voorbereiding voor de lunch tot een Pokemon Trainer verschijnt en daagt Ash, die graag van dienst. Met zijn Bulbasaur , Squirtle en Pikachu, Ash verslaat met gemak de Pokemon Trainer. Wat hij niet weet is dat hij in de gaten gehouden, niet alleen door Team Rocket, maar door een mysterieuze derde partij. Jessie , James en Meowth , die ook het kijken naar de strijd, hebben geen eten en kijken hongerig als de bende eet Brock's koken. Plotseling, een Dragonite vliegt binnen met een brief voor Ash en zijn vrienden. Het projecteert een hologram van een mysterieuze vrouw die vertelt de Trainers aan het hoofd van een pier in om te krijgen naar een eiland fort genaamd New Island .

Later, toen een storm brouwt, de bende komen op de Pokemon Center , wiens zuster Joy heeft gemist al een tijdje. agent Jenny informeert de Trainers verzameld dat de veerboot naar New Island is geannuleerd. Miranda , de pier meester vertelt hen dat Ze woont op de pier haar hele leven en dat de huidige storm is de hevigste die ze ooit heeft gezien. Ze dan een verhaal vertelt aan iedereen die aanwezig is over de manier waarop sommige mensen omgekomen in een storm vele jaren geleden, maar legende gaat dat de tranen van een Pokemon de mensen weer tot leven.

Al snel, de meeste andere Pokemon Trainers - het negeren van Jenny en Miranda de waarschuwingen van - uit te trekken voor het New Island. Ash en zijn vrienden staan ​​te popelen om te volgen, maar geen van hun Pokemon zijn sterk genoeg om de enorme golven te verwerken. Team Rocket, onder vermomming, geeft Ash en de bende een boottocht. Later werd Team Rocket's vermomming ontdekt. Echter, de storm blijkt te veel voor hen, en de sterke wind en de golven slaan tegen de boot, het kapseisde en iedereen werd gestuurd in de oceaan. De bende zichzelf gered door met behulp van Ash's Squirtle en Misty's Staryu om helemaal naar New Island te krijgen.

Als de helden nauwelijks te komen tot New Island, het mysterie vrouw uit het hologram brief groet ze en brengt ze naar de eetzaal om te voldoen aan de andere trainers die veilig aangekomen. Brock zegt dat ze vertrouwd leek, maar de vrouw ontkent het en toont hen naar het kasteel.

Ondertussen proberen als Team Rocket te krijgen in het fort, de legendarische Mew zintuigen iets verontrustend en komt uit op New Island, en volgt vlak achter Team Rocket.

Als ze aankomen in de eetkamer, Ash en de bende voldoen aan drie Pokemon Trainers genaamd Neesha , Fergus , en Corey . Juist op dat moment, de mysterieuze vrouw introduceert iedereen in de kamer om haar meester, die is geopenbaard aan niemand minder dan Mewtwo zijn. Fergus beledigingen Mewtwo, die stuurt hem vliegen; Fergus heeft zijn Gyarados aanval met Hyper Beam , maar Mewtwo gemakkelijk weerspiegelt het. Dan, Mewtwo de vrouw van zijn macht brengt, Brock vangt snel haar, en het is gebleken dat het mysterie vrouw is de ontbrekende Zuster Joy. Mewtwo vertelt de trainers dat de mens zwak en wreed, en hebben alle Pokemon hun slaven. Hij zegt ook dat Pokemon zijn niet beter af, omdat zij ervoor kiezen om te associëren met mensen.

Als Team Rocket krijgt in het fort en maken hun weg in een laboratorium, stuiten ze op een vreemd uitziende machine, een computer en een aantal Pokemon slapen in reusachtige peulen. Jessie zit per ongeluk op de computer controles, die het afspelen van een opgenomen bericht van Dr Fuji over de versteende wimper van Mew die is gemaakt om Mewtwo te vormen. Plotseling, neemt de machine een stuk haar van Meowth om een ​​kloon van hem te creëren. De gekloonde Pokemon wakker (via Mewtwo) en uitgang naar hun meester.

Mewtwo leidt Ash en de andere trainers in het stadion een deel van het fort en stelt dat zij Pokemon strijden om te zien wie de sterkste is, de klonen ten opzichte van de originelen. Ash Charizard , Corey's Venusaur , en Neesha's Blastoise zijn geen partij voor Mewtwo's klonen, en hij beweert dat de originelen met zijn eigen gespecialiseerde Poke Balls , de Clone Balls. Mewtwo kondigt dan dat de andere Pokemon zullen worden genomen om te worden gekloond. De klonen zullen veilig op het eiland blijven, terwijl Mewtwo's stormen te vernietigen de planeet. Hij stuurt vervolgens de ballen na de Pokemon.

Onmiddellijk alle trainers zijn op de vlucht. Sommige Pokemon worden gevangen voordat ze zich realiseren wat er gebeurt, terwijl sommige poging om de Clone Balls en enkele poging om hun aanvallen te gebruiken om zichzelf te verdedigen ontlopen. Het bleek echter te zijn nutteloos als de Pokemon worden allemaal opgevangen op een rijtje. Ash met de gedachte dat Pokemon die in hun Poke Balls niet kunnen worden vastgelegd, herinnert Bulbasaur en Squirtle , maar het blijkt geen nut zijn, zoals de Clone Balls in plaats vastleggen van de Poke Balls met Bulbasaur en Squirtle nog steeds binnen. Brock stelt voor het dragen van de Pokemon weg, maar terwijl Misty succes verbergt haar Togepi in haar tas, Psyduck en Vulpix zijn niet zo gelukkig en worden ook gevangen genomen.

Pikachu is de enige Pokemon nog steeds niet-gevangen, met als gevolg dat hij nu de enige doelstelling van de Clone Balls. Ash gebruikt zijn lichaam om blokkeren, waardoor Pikachu een kans om te draaien. Pikachu op weg naar een nabijgelegen opgeschort trap en maakt gebruik van Thundershock tot het afsluiten van een paar van de Clone Balls. Ash volgt hem op de trap. Pikachu is gedwongen om zijn Thundershock om de paar seconden, die in combinatie met voortdurend op de vlucht, laat hem uitgeput te gebruiken. Als gevolg hiervan wordt Pikachu gedwongen van de trap, terwijl het ontwijken van de ballen, valt een lange weg. Ash springt uit na Pikachu te beschermen hem, maar voordat hij kan grijpen zijn vriend, een Clone Ball uiteindelijk weet te vangen Pikachu. Ash pakt de bal voordat hij valt in de plas water aan de voet van de trap, en verliest zijn greep op het water. Ash volgt het, uit het zwembad, en naar de ingang van het laboratorium waar Team Rocket is.

Dezelfde machine die Meowth eerder gekloonde is nu de verwerking van alle van de Clone Balls, en Ash pakt de een Pikachu is net als de machine doet ook. Vechten tegen veel van de machine armen, Ash beheert uiteindelijk tot de Clone bal weg te krijgen, het vernietigen van de machine in het proces. Pikachu vrijkomt uit de Clone Ball en schudt zich af. Gelukkig is hij herenigd met Ash, maar de klonen zijn nu bevrijd van hun stasis buizen, bereid om Mewtwo te sluiten. De overige Clone Balls vrijkomen uit de machine in een explosie, en alle openstaande om de Pokemon in te bevrijden, met inbegrip van Squirtle en Bulbasaur en hun Poke Balls.

Mewtwo brengt de andere mensen en wordt al snel gezelschap van zijn kloon leger. Ash komt uit de rook met zijn en elke Trainer's Pokemon. Ash zegt dat ze zal niet toestaan ​​dat Mewtwo het plan slagen, en hij probeert punch Mewtwo, maar Mewtwo's krachtveld slaat hem neer. Ash gaat in voor een andere stoot, maar deze keer Mewtwo stuurt hem vliegen. Op dat moment, na het horen van alle commotie, Mew vliegt naar beneden en zorgt voor een gigantische zeepbel, die landt as op, het breken van zijn val. De speelse Pokemon wordt al snel aangevallen door de kloon; Mewtwo zegt dat klonen zijn veel krachtiger dan de originelen, maar Mew vertelt hem (via Meowth's vertalen) dat de echte kracht van een Pokemon komt uit het hart. Mewtwo gooit vol walging een andere energie-bal bij Mew, maar ontwijkt, maar de explosie raakt Ash. Met Mewtwo het blokkeren van alle de speciale moves Pokemon, een gigantische strijd begint tussen de Pokemon en hun klonen.

Ash overleeft de explosie, maar is met afschuw vervuld om alle Pokemon te vechten hun klonen, in het bijzonder Pikachu raken eindeloos geslagen door zijn te zien kloon . Hij valt uiteindelijk terug naar het stadion vloer, waardoor Misty Brock en Joy te komen hem te hulp. Ze zien nu hoe verschrikkelijk dit soort gevechten is en dat de originelen en klonen zal nooit opgeven, wat resulteert in hun dood. Ash realiseert iemand heeft om een standpunt in te nemen en te weigeren om te vechten, net als Pikachu is.

Als Team Rocket ook op te kijken met afgrijzen, Meowth gesprekken met zijn kloon over hoe, hoe verschillend mensen ook zijn, allemaal hebben ze veel gemeen op deze planeet.

Net als Mew en Mewtwo staat op het punt om elkaar af met enorme energie ontploffing, Ash, boos door de voortdurende gevechten, loopt tussen hen en eiste ze om te stoppen. De twee ontploffing van energie in contact komen met hem samen en - zijn zo krachtig - het blijkt hem in steen.

Het stadion stil wordt, met uitzondering van Pikachu, die loopt naar de andere kant van Ash. Na het proberen om hem wakker te maken, Pikachu gebruikt zijn Thunderbolt tevergeefs, zoals Ash onbeweeglijk blijft. Pikachu begint te huilen om het verlies van zijn vriend, net als de rest van de aanwezigen in het stadion te wijten aan het offer van Ash. De tranen van alle Pokemon samenkomen en op magische wijze te doen herleven Ash, om hem weer tot leven, net als in het verhaal Miranda vertelde eerder.

Na het getuigen van dit alles, Mewtwo stelt dat het niet uitmaakt wie is krachtiger, dat het klonen en originelen beide waarde hebben, en dat de omstandigheden van je geboorte is niet relevant: het is wat men doet met het leven dat men het lot bepaalt. Hij zegt ook dat het beste zou zijn als niemand wist wat er gebeurde. Wanneer Mewtwo vliegt weg, vertelt hij Ash dat hij zal vinden een plek waar hij en de klonen in vrede kunnen leven. Als gevolg hiervan worden alle herinneringen aan deze gebeurtenis gewist van de Trainers 'geesten.

Ash, Misty, Brock, en iedereen direct te vinden zich terug in het Pokemon Center met geen herinnering van hun avontuur op New Island. Zuster Joy is ook weer terug en biedt beschutting tegen de storm. Uitgaan naar de pier, Ash ziet een Mew in de wolken als de storm eindigt, maar Misty en Brock niet. Ash lacht alleen maar, wetende dat zijn reis nog maar net begonnen.

Dr Fuji , de wil om een manier om het leven te herstellen door klonen te vinden, gaat naar Guyana na het vinden van het bewijs van een heiligdom gewijd aan Mew , 's werelds meest krachtige - maar nu gezegd dat ze uitgestorven -. Pokemon Giovanni , de leider van Team Rocket , fondsen Fuji Het onderzoek in ruil voor een verbeterde woon replica van Mew. Het vinden van een fossiel van Mew, Fuji en zijn team creëren Mewtwo . Een verwarde Mewtwo vraagt ​​zich af wie hij is, wat hij is, en waar hij vandaan kwam. Op dat moment Mewtwo wordt wakker in een stasis buis in een van de Fuji's laboratoria, waar de wetenschappers bestuderen hem. Mewtwo breekt uit zijn reageerbuis; Dr Fuji vertelt Mewtwo dat hij is gemaakt door mensen en is een kloon, veel krachtiger dan Mew. Mewtwo is boos dat de wetenschappers hem meer zien als een eindresultaat om hun project en minder van een bewust wezen, zodat hij vernietigt het laboratorium en doodt alle wetenschappers. Dr Fuji zegt tegen zichzelf dat hij er in geslaagd 's werelds meest krachtige Pokemon alvorens te sterven in de handen van Mewtwo. Dan, Giovanni komt in zijn prive-helikopter en biedt aan te helpen Mewtwo focussen zijn bevoegdheden. Mewtwo neemt het aanbod, en wordt in een harnas.

In de komende weken, Mewtwo doet het meeste vuil Team Rocket het werk, het vastleggen van wilde Pokemon en het verslaan van alle trainers die in de Gym komen in Viridian City , met inbegrip van Gary Oak . Toen Giovanni vertelt Mewtwo zijn eigen verdraaide manier van het regelen van Pokemon, Mewtwo boos ontploffing weg, het vernietigen van zijn harnas, en - boven op het eiland dat hij is gemaakt op - geloften om te beginnen met zijn regering op aarde.

Ondertussen, Ash , Misty en Brock zijn voorbereiding voor de lunch tot een Pokemon Trainer verschijnt en daagt Ash, die graag van dienst. Met zijn Bulbasaur , Squirtle en Pikachu, Ash verslaat met gemak de Pokemon Trainer. Wat hij niet weet is dat hij in de gaten gehouden, niet alleen door Team Rocket, maar door een mysterieuze derde partij. Jessie , James en Meowth , die ook het kijken naar de strijd, hebben geen eten en kijken hongerig als de bende eet Brock's koken. Plotseling, een Dragonite vliegt binnen met een brief voor Ash en zijn vrienden. Het projecteert een hologram van een mysterieuze vrouw die vertelt de Trainers aan het hoofd van een pier in om te krijgen naar een eiland fort genaamd New Island .

Later, toen een storm brouwt, de bende komen op de Pokemon Center , wiens zuster Joy heeft gemist al een tijdje. agent Jenny informeert de Trainers verzameld dat de veerboot naar New Island is geannuleerd. Miranda , de pier meester vertelt hen dat Ze woont op de pier haar hele leven en dat de huidige storm is de hevigste die ze ooit heeft gezien. Ze dan een verhaal vertelt aan iedereen die aanwezig is over de manier waarop sommige mensen omgekomen in een storm vele jaren geleden, maar legende gaat dat de tranen van een Pokemon de mensen weer tot leven.

Al snel, de meeste andere Pokemon Trainers - het negeren van Jenny en Miranda de waarschuwingen van - uit te trekken voor het New Island. Ash en zijn vrienden staan ​​te popelen om te volgen, maar geen van hun Pokemon zijn sterk genoeg om de enorme golven te verwerken. Team Rocket, onder vermomming, geeft Ash en de bende een boottocht. Later werd Team Rocket's vermomming ontdekt. Echter, de storm blijkt te veel voor hen, en de sterke wind en de golven slaan tegen de boot, het kapseisde en iedereen werd gestuurd in de oceaan. De bende zichzelf gered door met behulp van Ash's Squirtle en Misty's Staryu om helemaal naar New Island te krijgen.

Als de helden nauwelijks te komen tot New Island, het mysterie vrouw uit het hologram brief groet ze en brengt ze naar de eetzaal om te voldoen aan de andere trainers die veilig aangekomen. Brock zegt dat ze vertrouwd leek, maar de vrouw ontkent het en toont hen naar het kasteel.

Ondertussen proberen als Team Rocket te krijgen in het fort, de legendarische Mew zintuigen iets verontrustend en komt uit op New Island, en volgt vlak achter Team Rocket.

Als ze aankomen in de eetkamer, Ash en de bende voldoen aan drie Pokemon Trainers genaamd Neesha , Fergus , en Corey . Juist op dat moment, de mysterieuze vrouw introduceert iedereen in de kamer om haar meester, die is geopenbaard aan niemand minder dan Mewtwo zijn. Fergus beledigingen Mewtwo, die stuurt hem vliegen; Fergus heeft zijn Gyarados aanval met Hyper Beam , maar Mewtwo gemakkelijk weerspiegelt het. Dan, Mewtwo de vrouw van zijn macht brengt, Brock vangt snel haar, en het is gebleken dat het mysterie vrouw is de ontbrekende Zuster Joy. Mewtwo vertelt de trainers dat de mens zwak en wreed, en hebben alle Pokemon hun slaven. Hij zegt ook dat Pokemon zijn niet beter af, omdat zij ervoor kiezen om te associëren met mensen.

Als Team Rocket krijgt in het fort en maken hun weg in een laboratorium, stuiten ze op een vreemd uitziende machine, een computer en een aantal Pokemon slapen in reusachtige peulen. Jessie zit per ongeluk op de computer controles, die het afspelen van een opgenomen bericht van Dr Fuji over de versteende wimper van Mew die is gemaakt om Mewtwo te vormen. Plotseling, neemt de machine een stuk haar van Meowth om een ​​kloon van hem te creëren. De gekloonde Pokemon wakker (via Mewtwo) en uitgang naar hun meester.

Mewtwo leidt Ash en de andere trainers in het stadion een deel van het fort en stelt dat zij Pokemon strijden om te zien wie de sterkste is, de klonen ten opzichte van de originelen. Ash Charizard , Corey's Venusaur , en Neesha's Blastoise zijn geen partij voor Mewtwo's klonen, en hij beweert dat de originelen met zijn eigen gespecialiseerde Poke Balls , de Clone Balls. Mewtwo kondigt dan dat de andere Pokemon zullen worden genomen om te worden gekloond. De klonen zullen veilig op het eiland blijven, terwijl Mewtwo's stormen te vernietigen de planeet. Hij stuurt vervolgens de ballen na de Pokemon.

Onmiddellijk alle trainers zijn op de vlucht. Sommige Pokemon worden gevangen voordat ze zich realiseren wat er gebeurt, terwijl sommige poging om de Clone Balls en enkele poging om hun aanvallen te gebruiken om zichzelf te verdedigen ontlopen. Het bleek echter te zijn nutteloos als de Pokemon worden allemaal opgevangen op een rijtje. Ash met de gedachte dat Pokemon die in hun Poke Balls niet kunnen worden vastgelegd, herinnert Bulbasaur en Squirtle , maar het blijkt geen nut zijn, zoals de Clone Balls in plaats vastleggen van de Poke Balls met Bulbasaur en Squirtle nog steeds binnen. Brock stelt voor het dragen van de Pokemon weg, maar terwijl Misty succes verbergt haar Togepi in haar tas, Psyduck en Vulpix zijn niet zo gelukkig en worden ook gevangen genomen.

Pikachu is de enige Pokemon nog steeds niet-gevangen, met als gevolg dat hij nu de enige doelstelling van de Clone Balls. Ash gebruikt zijn lichaam om blokkeren, waardoor Pikachu een kans om te draaien. Pikachu op weg naar een nabijgelegen opgeschort trap en maakt gebruik van Thundershock tot het afsluiten van een paar van de Clone Balls. Ash volgt hem op de trap. Pikachu is gedwongen om zijn Thundershock om de paar seconden, die in combinatie met voortdurend op de vlucht, laat hem uitgeput te gebruiken. Als gevolg hiervan wordt Pikachu gedwongen van de trap, terwijl het ontwijken van de ballen, valt een lange weg. Ash springt uit na Pikachu te beschermen hem, maar voordat hij kan grijpen zijn vriend, een Clone Ball uiteindelijk weet te vangen Pikachu. Ash pakt de bal voordat hij valt in de plas water aan de voet van de trap, en verliest zijn greep op het water. Ash volgt het, uit het zwembad, en naar de ingang van het laboratorium waar Team Rocket is.

Dezelfde machine die Meowth eerder gekloonde is nu de verwerking van alle van de Clone Balls, en Ash pakt de een Pikachu is net als de machine doet ook. Vechten tegen veel van de machine armen, Ash beheert uiteindelijk tot de Clone bal weg te krijgen, het vernietigen van de machine in het proces. Pikachu vrijkomt uit de Clone Ball en schudt zich af. Gelukkig is hij herenigd met Ash, maar de klonen zijn nu bevrijd van hun stasis buizen, bereid om Mewtwo te sluiten. De overige Clone Balls vrijkomen uit de machine in een explosie, en alle openstaande om de Pokemon in te bevrijden, met inbegrip van Squirtle en Bulbasaur en hun Poke Balls.

Mewtwo brengt de andere mensen en wordt al snel gezelschap van zijn kloon leger. Ash komt uit de rook met zijn en elke Trainer's Pokemon. Ash zegt dat ze zal niet toestaan ​​dat Mewtwo het plan slagen, en hij probeert punch Mewtwo, maar Mewtwo's krachtveld slaat hem neer. Ash gaat in voor een andere stoot, maar deze keer Mewtwo stuurt hem vliegen. Op dat moment, na het horen van alle commotie, Mew vliegt naar beneden en zorgt voor een gigantische zeepbel, die landt as op, het breken van zijn val. De speelse Pokemon wordt al snel aangevallen door de kloon; Mewtwo zegt dat klonen zijn veel krachtiger dan de originelen, maar Mew vertelt hem (via Meowth's vertalen) dat de echte kracht van een Pokemon komt uit het hart. Mewtwo gooit vol walging een andere energie-bal bij Mew, maar ontwijkt, maar de explosie raakt Ash. Met Mewtwo het blokkeren van alle de speciale moves Pokemon, een gigantische strijd begint tussen de Pokemon en hun klonen.

Ash overleeft de explosie, maar is met afschuw vervuld om alle Pokemon te vechten hun klonen, in het bijzonder Pikachu raken eindeloos geslagen door zijn te zien kloon . Hij valt uiteindelijk terug naar het stadion vloer, waardoor Misty Brock en Joy te komen hem te hulp. Ze zien nu hoe verschrikkelijk dit soort gevechten is en dat de originelen en klonen zal nooit opgeven, wat resulteert in hun dood. Ash realiseert iemand heeft om een standpunt in te nemen en te weigeren om te vechten, net als Pikachu is.

Als Team Rocket ook op te kijken met afgrijzen, Meowth gesprekken met zijn kloon over hoe, hoe verschillend mensen ook zijn, allemaal hebben ze veel gemeen op deze planeet.

Net als Mew en Mewtwo staat op het punt om elkaar af met enorme energie ontploffing, Ash, boos door de voortdurende gevechten, loopt tussen hen en eiste ze om te stoppen. De twee ontploffing van energie in contact komen met hem samen en - zijn zo krachtig - het blijkt hem in steen.

Het stadion stil wordt, met uitzondering van Pikachu, die loopt naar de andere kant van Ash. Na het proberen om hem wakker te maken, Pikachu gebruikt zijn Thunderbolt tevergeefs, zoals Ash onbeweeglijk blijft. Pikachu begint te huilen om het verlies van zijn vriend, net als de rest van de aanwezigen in het stadion te wijten aan het offer van Ash. De tranen van alle Pokemon samenkomen en op magische wijze te doen herleven Ash, om hem weer tot leven, net als in het verhaal Miranda vertelde eerder.

Na het getuigen van dit alles, Mewtwo stelt dat het niet uitmaakt wie is krachtiger, dat het klonen en originelen beide waarde hebben, en dat de omstandigheden van je geboorte is niet relevant: het is wat men doet met het leven dat men het lot bepaalt. Hij zegt ook dat het beste zou zijn als niemand wist wat er gebeurde. Wanneer Mewtwo vliegt weg, vertelt hij Ash dat hij zal vinden een plek waar hij en de klonen in vrede kunnen leven. Als gevolg hiervan worden alle herinneringen aan deze gebeurtenis gewist van de Trainers 'geesten.

Ash, Misty, Brock, en iedereen direct te vinden zich terug in het Pokemon Center met geen herinnering van hun avontuur op New Island. Zuster Joy is ook weer terug en biedt beschutting tegen de storm. Uitgaan naar de pier, Ash ziet een Mew in de wolken als de storm eindigt, maar Misty en Brock niet. Ash lacht alleen maar, wetende dat zijn reis nog maar net begonnen.

Dr Fuji , de wil om een manier om het leven te herstellen door klonen te vinden, gaat naar Guyana na het vinden van het bewijs van een heiligdom gewijd aan Mew , 's werelds meest krachtige - maar nu gezegd dat ze uitgestorven -. Pokemon Giovanni , de leider van Team Rocket , fondsen Fuji Het onderzoek in ruil voor een verbeterde woon replica van Mew. Het vinden van een fossiel van Mew, Fuji en zijn team creëren Mewtwo . Een verwarde Mewtwo vraagt ​​zich af wie hij is, wat hij is, en waar hij vandaan kwam. Op dat moment Mewtwo wordt wakker in een stasis buis in een van de Fuji's laboratoria, waar de wetenschappers bestuderen hem. Mewtwo breekt uit zijn reageerbuis; Dr Fuji vertelt Mewtwo dat hij is gemaakt door mensen en is een kloon, veel krachtiger dan Mew. Mewtwo is boos dat de wetenschappers hem meer zien als een eindresultaat om hun project en minder van een bewust wezen, zodat hij vernietigt het laboratorium en doodt alle wetenschappers. Dr Fuji zegt tegen zichzelf dat hij er in geslaagd 's werelds meest krachtige Pokemon alvorens te sterven in de handen van Mewtwo. Dan, Giovanni komt in zijn prive-helikopter en biedt aan te helpen Mewtwo focussen zijn bevoegdheden. Mewtwo neemt het aanbod, en wordt in een harnas.

In de komende weken, Mewtwo doet het meeste vuil Team Rocket het werk, het vastleggen van wilde Pokemon en het verslaan van alle trainers die in de Gym komen in Viridian City , met inbegrip van Gary Oak . Toen Giovanni vertelt Mewtwo zijn eigen verdraaide manier van het regelen van Pokemon, Mewtwo boos ontploffing weg, het vernietigen van zijn harnas, en - boven op het eiland dat hij is gemaakt op - geloften om te beginnen met zijn regering op aarde.

Ondertussen, Ash , Misty en Brock zijn voorbereiding voor de lunch tot een Pokemon Trainer verschijnt en daagt Ash, die graag van dienst. Met zijn Bulbasaur , Squirtle en Pikachu, Ash verslaat met gemak de Pokemon Trainer. Wat hij niet weet is dat hij in de gaten gehouden, niet alleen door Team Rocket, maar door een mysterieuze derde partij. Jessie , James en Meowth , die ook het kijken naar de strijd, hebben geen eten en kijken hongerig als de bende eet Brock's koken. Plotseling, een Dragonite vliegt binnen met een brief voor Ash en zijn vrienden. Het projecteert een hologram van een mysterieuze vrouw die vertelt de Trainers aan het hoofd van een pier in om te krijgen naar een eiland fort genaamd New Island .

Later, toen een storm brouwt, de bende komen op de Pokemon Center , wiens zuster Joy heeft gemist al een tijdje. agent Jenny informeert de Trainers verzameld dat de veerboot naar New Island is geannuleerd. Miranda , de pier meester vertelt hen dat Ze woont op de pier haar hele leven en dat de huidige storm is de hevigste die ze ooit heeft gezien. Ze dan een verhaal vertelt aan iedereen die aanwezig is over de manier waarop sommige mensen omgekomen in een storm vele jaren geleden, maar legende gaat dat de tranen van een Pokemon de mensen weer tot leven.

Al snel, de meeste andere Pokemon Trainers - het negeren van Jenny en Miranda de waarschuwingen van - uit te trekken voor het New Island. Ash en zijn vrienden staan ​​te popelen om te volgen, maar geen van hun Pokemon zijn sterk genoeg om de enorme golven te verwerken. Team Rocket, onder vermomming, geeft Ash en de bende een boottocht. Later werd Team Rocket's vermomming ontdekt. Echter, de storm blijkt te veel voor hen, en de sterke wind en de golven slaan tegen de boot, het kapseisde en iedereen werd gestuurd in de oceaan. De bende zichzelf gered door met behulp van Ash's Squirtle en Misty's Staryu om helemaal naar New Island te krijgen.

Als de helden nauwelijks te komen tot New Island, het mysterie vrouw uit het hologram brief groet ze en brengt ze naar de eetzaal om te voldoen aan de andere trainers die veilig aangekomen. Brock zegt dat ze vertrouwd leek, maar de vrouw ontkent het en toont hen naar het kasteel.

Ondertussen proberen als Team Rocket te krijgen in het fort, de legendarische Mew zintuigen iets verontrustend en komt uit op New Island, en volgt vlak achter Team Rocket.

Als ze aankomen in de eetkamer, Ash en de bende voldoen aan drie Pokemon Trainers genaamd Neesha , Fergus , en Corey . Juist op dat moment, de mysterieuze vrouw introduceert iedereen in de kamer om haar meester, die is geopenbaard aan niemand minder dan Mewtwo zijn. Fergus beledigingen Mewtwo, die stuurt hem vliegen; Fergus heeft zijn Gyarados aanval met Hyper Beam , maar Mewtwo gemakkelijk weerspiegelt het. Dan, Mewtwo de vrouw van zijn macht brengt, Brock vangt snel haar, en het is gebleken dat het mysterie vrouw is de ontbrekende Zuster Joy. Mewtwo vertelt de trainers dat de mens zwak en wreed, en hebben alle Pokemon hun slaven. Hij zegt ook dat Pokemon zijn niet beter af, omdat zij ervoor kiezen om te associëren met mensen.

Als Team Rocket krijgt in het fort en maken hun weg in een laboratorium, stuiten ze op een vreemd uitziende machine, een computer en een aantal Pokemon slapen in reusachtige peulen. Jessie zit per ongeluk op de computer controles, die het afspelen van een opgenomen bericht van Dr Fuji over de versteende wimper van Mew die is gemaakt om Mewtwo te vormen. Plotseling, neemt de machine een stuk haar van Meowth om een ​​kloon van hem te creëren. De gekloonde Pokemon wakker (via Mewtwo) en uitgang naar hun meester.

Mewtwo leidt Ash en de andere trainers in het stadion een deel van het fort en stelt dat zij Pokemon strijden om te zien wie de sterkste is, de klonen ten opzichte van de originelen. Ash Charizard , Corey's Venusaur , en Neesha's Blastoise zijn geen partij voor Mewtwo's klonen, en hij beweert dat de originelen met zijn eigen gespecialiseerde Poke Balls , de Clone Balls. Mewtwo kondigt dan dat de andere Pokemon zullen worden genomen om te worden gekloond. De klonen zullen veilig op het eiland blijven, terwijl Mewtwo's stormen te vernietigen de planeet. Hij stuurt vervolgens de ballen na de Pokemon.

Onmiddellijk alle trainers zijn op de vlucht. Sommige Pokemon worden gevangen voordat ze zich realiseren wat er gebeurt, terwijl sommige poging om de Clone Balls en enkele poging om hun aanvallen te gebruiken om zichzelf te verdedigen ontlopen. Het bleek echter te zijn nutteloos als de Pokemon worden allemaal opgevangen op een rijtje. Ash met de gedachte dat Pokemon die in hun Poke Balls niet kunnen worden vastgelegd, herinnert Bulbasaur en Squirtle , maar het blijkt geen nut zijn, zoals de Clone Balls in plaats vastleggen van de Poke Balls met Bulbasaur en Squirtle nog steeds binnen. Brock stelt voor het dragen van de Pokemon weg, maar terwijl Misty succes verbergt haar Togepi in haar tas, Psyduck en Vulpix zijn niet zo gelukkig en worden ook gevangen genomen.

Pikachu is de enige Pokemon nog steeds niet-gevangen, met als gevolg dat hij nu de enige doelstelling van de Clone Balls. Ash gebruikt zijn lichaam om blokkeren, waardoor Pikachu een kans om te draaien. Pikachu op weg naar een nabijgelegen opgeschort trap en maakt gebruik van Thundershock tot het afsluiten van een paar van de Clone Balls. Ash volgt hem op de trap. Pikachu is gedwongen om zijn Thundershock om de paar seconden, die in combinatie met voortdurend op de vlucht, laat hem uitgeput te gebruiken. Als gevolg hiervan wordt Pikachu gedwongen van de trap, terwijl het ontwijken van de ballen, valt een lange weg. Ash springt uit na Pikachu te beschermen hem, maar voordat hij kan grijpen zijn vriend, een Clone Ball uiteindelijk weet te vangen Pikachu. Ash pakt de bal voordat hij valt in de plas water aan de voet van de trap, en verliest zijn greep op het water. Ash volgt het, uit het zwembad, en naar de ingang van het laboratorium waar Team Rocket is.

Dezelfde machine die Meowth eerder gekloonde is nu de verwerking van alle van de Clone Balls, en Ash pakt de een Pikachu is net als de machine doet ook. Vechten tegen veel van de machine armen, Ash beheert uiteindelijk tot de Clone bal weg te krijgen, het vernietigen van de machine in het proces. Pikachu vrijkomt uit de Clone Ball en schudt zich af. Gelukkig is hij herenigd met Ash, maar de klonen zijn nu bevrijd van hun stasis buizen, bereid om Mewtwo te sluiten. De overige Clone Balls vrijkomen uit de machine in een explosie, en alle openstaande om de Pokemon in te bevrijden, met inbegrip van Squirtle en Bulbasaur en hun Poke Balls.

Mewtwo brengt de andere mensen en wordt al snel gezelschap van zijn kloon leger. Ash komt uit de rook met zijn en elke Trainer's Pokemon. Ash zegt dat ze zal niet toestaan ​​dat Mewtwo het plan slagen, en hij probeert punch Mewtwo, maar Mewtwo's krachtveld slaat hem neer. Ash gaat in voor een andere stoot, maar deze keer Mewtwo stuurt hem vliegen. Op dat moment, na het horen van alle commotie, Mew vliegt naar beneden en zorgt voor een gigantische zeepbel, die landt as op, het breken van zijn val. De speelse Pokemon wordt al snel aangevallen door de kloon; Mewtwo zegt dat klonen zijn veel krachtiger dan de originelen, maar Mew vertelt hem (via Meowth's vertalen) dat de echte kracht van een Pokemon komt uit het hart. Mewtwo gooit vol walging een andere energie-bal bij Mew, maar ontwijkt, maar de explosie raakt Ash. Met Mewtwo het blokkeren van alle de speciale moves Pokemon, een gigantische strijd begint tussen de Pokemon en hun klonen.

Ash overleeft de explosie, maar is met afschuw vervuld om alle Pokemon te vechten hun klonen, in het bijzonder Pikachu raken eindeloos geslagen door zijn te zien kloon . Hij valt uiteindelijk terug naar het stadion vloer, waardoor Misty Brock en Joy te komen hem te hulp. Ze zien nu hoe verschrikkelijk dit soort gevechten is en dat de originelen en klonen zal nooit opgeven, wat resulteert in hun dood. Ash realiseert iemand heeft om een standpunt in te nemen en te weigeren om te vechten, net als Pikachu is.

Als Team Rocket ook op te kijken met afgrijzen, Meowth gesprekken met zijn kloon over hoe, hoe verschillend mensen ook zijn, allemaal hebben ze veel gemeen op deze planeet.

Net als Mew en Mewtwo staat op het punt om elkaar af met enorme energie ontploffing, Ash, boos door de voortdurende gevechten, loopt tussen hen en eiste ze om te stoppen. De twee ontploffing van energie in contact komen met hem samen en - zijn zo krachtig - het blijkt hem in steen.

Het stadion stil wordt, met uitzondering van Pikachu, die loopt naar de andere kant van Ash. Na het proberen om hem wakker te maken, Pikachu gebruikt zijn Thunderbolt tevergeefs, zoals Ash onbeweeglijk blijft. Pikachu begint te huilen om het verlies van zijn vriend, net als de rest van de aanwezigen in het stadion te wijten aan het offer van Ash. De tranen van alle Pokemon samenkomen en op magische wijze te doen herleven Ash, om hem weer tot leven, net als in het verhaal Miranda vertelde eerder.

Na het getuigen van dit alles, Mewtwo stelt dat het niet uitmaakt wie is krachtiger, dat het klonen en originelen beide waarde hebben, en dat de omstandigheden van je geboorte is niet relevant: het is wat men doet met het leven dat men het lot bepaalt. Hij zegt ook dat het beste zou zijn als niemand wist wat er gebeurde. Wanneer Mewtwo vliegt weg, vertelt hij Ash dat hij zal vinden een plek waar hij en de klonen in vrede kunnen leven. Als gevolg hiervan worden alle herinneringen aan deze gebeurtenis gewist van de Trainers 'geesten.

Ash, Misty, Brock, en iedereen direct te vinden zich terug in het Pokemon Center met geen herinnering van hun avontuur op New Island. Zuster Joy is ook weer terug en biedt beschutting tegen de storm. Uitgaan naar de pier, Ash ziet een Mew in de wolken als de storm eindigt, maar Misty en Brock niet. Ash lacht alleen maar, wetende dat zijn reis nog maar net begonnen.